Южночешский университет Чешские Будейовице
был основан 28 сентября 1991 года на базе двух факультетов – педагогоческого (с 1948 года являвшимся отделением Карлового университета)и промышленно-экономического(od roku 1960 působila jako součást pražské Vysoké školy zemědělské) , к которым со временем были присоединены вновь образованные факультеты, биологический, теологический и социального здравоохранения. В 1996 году в структуру университета вошел исследовательский институт рыболовства и гидробиологии в Воднянах, а в 2002 году к университету был присоединен институт физикальной биологии в Новых Градех.
В настоящее время в университете действует 8 факультетов.
Южночешский университет является вузом с направленностью на изучение проблематики естественнонаучных, социальных и гуманитарных наук. Важным составляющим научно-исследовательской деятельности Южночешского университета является тесное сотрудничество с Академией наук Чешской Республики.
Университет предлагает обучение на 251 специальности бакалаврских, магистреских и докторских программ обучения для более, чем 13 000 студентов. Обучение проводится на чешском, английском и немецком языках.